Драган про ковид


Гео и язык канала: Россия, Русский
Категория: Медицина


Рассказываю про ковид и его варианты, про ход эпидемии в России и в других странах, про фальсификацию коронавирусной статистики — и вообще про всякое. Много нагнетаю и ворчу.

Связанные каналы

Гео и язык канала
Россия, Русский
Категория
Медицина
Статистика
Фильтр публикаций


Реанимировал московскую и петербургскую таблицы с графиками по госпитализациям.

28.8k 15 100 170 198


24.6k 0 37 240 146

Тем временем, похоже, выделены две новые сублинии омикрона. Встречайте BA.4 и BA.5.

Оба варианта обнаружены, как и прошлые три, в Южной Африке. Вирусолог Том Пикок предполагает, что они могли произойти из того же резервуара, из которого вышли варианты BA.1−BA.3 (популяция животных, хронически инфицированный больной с иммунодефицитом, некая замкнутая популяция и др.).

Доля BA.4/5 в ЮАР оценивается в 66%, больше всего сиквенсов обнаружено в провинции Гаутенг, той самой, с которой началась волна ещё первого омикрона. Сейчас новая сублиния с мутацией L452R в спайк-белке доминирует в Гаутенге, но выборка слишком мала, чтобы делать надёжные выводы — мы располагаем всего несколькими десятками сиквенсов. Уже есть образцы из Ботсваны, Дании и Великобритании — всего на 5 апреля 79 образцов.

Мутация S:L452R характерна для дельты — и это очень неприятная мутация. Исследования показали, что эта мутация повышает инфекционность и фузогенность вируса (а фузогенность связывают с патогенностью коронавируса; у оригинального омикрона BA.1 фузогенность была практически утрачена). В недавнем исследовании, опубликованном в Nature, создали омикрон с L452R и обнаружили, что омикрон с этой мутацией отличается более высокой вирусной нагрузкой и повышенной инфекционностью, а псевдовирус Omicron-L452R куда лучше заражал ткани лёгких гуманизированных мышей, в отличие от классического омикрона.

«Мутация L452R резко увеличивает опасность омикрона. Необходимо внимательно отслеживать появление вариантов омикрона с L452R и разрабатывать особые терапевтические антитела и вакцины, нацеленные на эту мутацию», — ещё в феврале писали авторы статьи.

Но L452R — далеко не единственная мутация BA.4/5, отличающая новые сублинии. Об их свойствах мы, вероятно, скоро узнаем больше: в ЮАР есть ранние признаки начала новой волны, а репродуктивное число неделю назад впервые с 19 декабря превысило 1 и сейчас достигло 1,38 — заболеваемость идёт в рост.

44.2k 12 290 551 292

Шанхай переживает сильнейшую вспышку омикрона. Рассказывает Дима Прусс:

В Шанхае за сутки число выявленных инфекций выросло в 1.5 раза до 13 тысяч, и обещанный выход половины города из карантина не состоялся. Весь город заперли, все 26 миллионов человек.

За сутки с небольшим всех перетестировали, но столько тестов они физически не могут сделать, а объединяют образцы от десяти и более человек в одну пробирку. Если в группе результат положительный, то перепроверяют всех её участников. Так пробовали делать и в некоторых местах в Америке, пока Омикрона было ещё мало. Но по мере повышения частоты заболевания групповые анализы теряют смысл, слишком много групп положительных, экономия исчезает.

Каким-то образом им удалось поднять весь объём работ с привлечением менее 40 тысяч работников из других регионов и военных. Это на грани возможного. Если 25 тысяч человек занимаются самим отбором образцов (а ведь кто-то должен заниматься порядком, лабораторным процессом, логистикой!), то это без сверхурочки требует скорости в 2 пациента в минуту!

Еды и медицины по прежнему не хватает, но главный больной вопрос - изоляция детей. Их отбирают у родителей. Все соцсети обошли фото младенцев, набитых скопом в одну детскую кроватку в коридоре центра изоляции. Власти в конце концов согласились, что если и родители, и дети заражены, то детей до 7 не отделят... но ведь часто положительный тест не у всех сразу.

Второй больной вопрос, это условия в обзерваторах и сроки пребывания. Никто не знает толком, на каких условиях изолированных выпустят, сколько потребуется тестов и когда.

Как сообщают местные, сегодня Шанхай способен обрабатывать до 4 млн пробирок в сутки, задержки с обработкой — обычное дело (прежде доходило максимум до 36 часов), а рост числа выявленных ожидался при таком поголовном тестировании.

В Шанхае распространилась сублиния BA.2. СМИ сообщают, что в соседнем городе обнаружили также новый подвариант ветки BA.1.1, который прежде нигде не встречался.

Так или иначе, происходящее в Китае — пока самое интересное в этом сезоне сериала. Но далеко не единственное, за чем стоит следить: чего стоит только Великобритания с очередной волной и рекордными госпитализациями с февраля 2021 года.

Другой важный сюжет в этом сериале — это эволюция вируса. Сублиния омикрона BA.2 не только продолжает захватывать мир, но и активно обрастает подвариантами. Среди деток BA.2 — уже более десяти подвариантов, от BA.2.1 до BA.2.10 (в ряде случаев есть и дочерние подварианты вроде BA.2.3.1).

Вирус мутирует и распространяется так быстро, что человечество не успевает изучать его свойства. И чем новые подварианты отличаются друг от друга, мы достоверно не знаем.

39k 17 510 94 249

Репост из: Включил Зеленского
​​1 134 506 избыточных смертей на конец февраля в России

Если вы думали, что эпидемия коронавируса закончилась, то в непривитой России это далеко не так. Уже сегодня министр здравоохранения Михаил Мурашко напомнил, что в некоторых регионах снова рост. При этом ограничения продолжают отменять, а про вакцину уже никто и не вспоминает.

Данные свежего Росстата тут
https://datalens.yandex/itvip8ty2nuab?tab=Nb

19.9k 0 155 190 157

Репост из: Безвольные каменщики
В NEJM опубликован [1] короткий ответ на вопрос "Почему я должен вакцинироваться, если я уже переболел". Ученые сравнивали, как антитела из крови переболевших омикроном нейтрализуют (выводят из игры) вирусы других штаммов в зависимости от того, были ли эти люди привиты и заражались ли раньше какими-нибудь другим штаммом коронавируса. Результаты сравнения представлены на картинке к этому посту.

Если коротко: заражение омикроном дает неплохую защиту против омикрона, а вот против других вариантов SARS-CoV-2 почти совсем защищает – хотя и против омикрона антител меньше, чем против других штаммов после заражения ими. Вакцинация или болезнь поднимают количество антител против других штаммов, но вакцинация делает это более или менее одинаково у всех привитых, а вот после предыдущей болезни у кого-то защита оказывается норм, а у кого-то ее нет вовсе.

Причин у таких отличий омикронного и неомикронного иммунитетов несколько. Во-первых, омикрон очень далеко ушел от других штаммов. Многие специалисты даже считают, что его можно считать отдельным серотипом, настолько противоомикронные антитела отличаются от антител против других вариантов. Во-вторых, в иммунологии имеет место эффект первородного греха. Этим термином называют феномен, заключающийся в том, что антитела против какого-то антигена являются потомками антител, сформировавшихся против той версии антигена, с которой организм встретился в самый первый раз (точнее, B-клетки, синтезирующие анитела, но для простоты опустим это). То есть антитела будут всегда лучше защищать от первой версии. С момента создания концепция первородного греха стала менее жесткой – мы знаем, что антитела против новых версий антигена тоже синтезируются, в том числе и de novo из наивных B-клеток, но, тем не менее, тенденция такая имеет место.

В результате, люди, переболевшие омикроном, не сформируют антител против других штаммов или сформируют их не очень много. И если в очередную вспышку SARS-CoV-2 придет вариант, эволюционировавший не из омикрона, а из какого-то из старых штаммов – а они еще сохранились, хотя и в небольшом количестве, и вполен могут проявить себя, когда человеческая популяция станет повально иммунна к омикрону, – такие люди будут снова легко заболевать, а те, кто принадлежит к группам риска, заболевать тяжело. Вакцинация уменьшает вероятность тяжелого течения, так как создает иммунную защиту против старых штаммов. Такие дела.

22k 0 82 76 167

Роспотребнадзор вчера: пора смягчать антиковидные ограничения в школах. Можно больше не закреплять отдельный кабинет для каждого класса, можно отменять зигзагообразную рассадку и дистанцию 1,5 метра между учениками при проведении аттестаций.

Рособрнадзор сегодня: переносим всероссийские проверочные работы в школах с весны на осень «в связи с прогнозируемым развитием эпидемиологической ситуации и сохранением рисков распространения COVID-19». Социальная дистанция и уменьшение контактов по-прежнему актуальны, есть риск новой волны в марте-апреле.

ВПР переносятся по всей стране — в том числе в тех регионах, которые неделю назад отменили масочный режим и сняли практически все ограничения по причине «стабильного улучшения эпидемиологической ситуации».

Как хорошо, что наконец-то вводятся превентивные меры задолго до начала подъёма. В отличие от первой волны омикрона в январе, когда и федералы, и регионы так сильно избегали дистанта и серьёзных ограничений для школьников, несмотря на 12 тысяч занятых педиатрических коек, переполненные детские больницы по всей стране и рекордную заболеваемость ковидом среди детей. Наконец-то мы видим борьбу с эпидемией.

22.7k 6 122 48 206

Немного поговорил с «Правмиром» о том, что происходит с ковидом в России и в других странах, сколько людей столкнулось с сублинией омикрона BA.1 и убережёт ли это нас от BA.2, которая сейчас даёт новый подъём в Европе, избежит ли Россия новой волны благодаря авиаблокаде, возможному грядущему закрытию многих точек общепита и снижению социальной активности. Читать здесь.


Не про ковид, но о смежном: генетик Дима Прусс разбирает недавнюю статью в «Комсомолке» о биологическом оружии и якобы его разработках в Украине, и аргументацию новоявленного эксперта КП — Александра Кудрявцева, одного из разработчиков «Бетувакса» (который и ранее неоднократно делал крайне спорные, скандальные или попросту опрометчивые заявления). Разбор детальный и тем более важный, что Прусс занимается изучением гаплотипов уже более 20 лет, читать по ссылке. Закрепить можно разбором Ольги Матвеевой по горячим следам.

Для расширения контекста — в прошлых сериях:
Интервью с Евгением Куниным, одним из самых цитируемых учёных мира, молекулярным биологом, членом Национальной академии наук США и иностранного члена РАН. Вывод Кунина:

«Я могу только сказать, что к науке это отношения уже не имеет. Вы знаете, я, конечно, невысокого мнения об уровне экспертизы тех, кто выдвигает все эти версии о биологическом оружии в Украине. Но все-таки я не считаю, что они до такой степени идиоты, чтобы говорить об этом всерьез. Они сознательно дезинформируют, прекрасно понимая бессмысленность собственных слов. Моя гипотеза: эти люди — сознательные манипуляторы. Хотя есть вероятность, что среди них есть и те, кого надо лечить».

Также Евгений Кунин запустил петицию, которую призывает подписывать биологов, чтобы остановить распространение дезинформации о биологическом оружии в Украине.

Разбор в Science.

• А здесь Ольга Матвеева сделала небольшой разбор литературы по теме биологического оружия.

• Микробиолог и генный инженер Евгений Левитин — об обвинениях в создании биологического оружия.

Хороший тред в Твиттере — результат работы учёных из Беларуси, России, Франции, Швеции.

Если удобнее слушать или смотреть:
Неплохой стрим Ирины Якутенко и Александра Плющева.

• Всё о том же — Александр Панчин.

Доклад Олега Балановского, д.б.н., руководителя лаборатории геномной географии Института общей генетики РАН.

• Разговор с Константином Севериновым — всё о том же.

15k 7 347 198 265

Содержимое скрыто

22.1k 8 294 83 223

Содержимое скрыто

15k 4 373 49 158

Смертность от ковида. Сравнение Гонконга с другими странами. Подробнее о происходящем в городе — в этом посте.


Содержимое скрыто

24.2k 28 230 33 115

Полторы две недели назад, до начала всем известных событий, подготовил большой обзор: как омикрон ударил по детям и почему именно волна омикрона оказалась худшей для детей.

• Что происходило с детскими госпитализациями в разных странах, какова доля «случайного» ковида и как вообще дети переносят болезнь: легче ли для них омикрон или тяжелей?

• С чем попадают в больницы и реанимации, опасней ли омикрон для детей, чем прошлые варианты и что показывают исследования?

• Почему пневмоний стало меньше, а смертей — больше?

• И почему омикрон тяжелее всего переносят маленькие дети?

Обо всём читайте в этом тексте.


Не везде закончился естественный локдаун.

Как сообщает РБК, из-за омикрона прямо сейчас на железнодорожных путях брошено почти 1600 поездов — это более 106 тыс. вагонов, или 10% от всего рабочего парка РЖД. 77% вагонов с грузами: 35 тыс. вагонов с каменным углём, 12 тыс. с нефтепродуктами, 8 тыс. с товарами в контейнерах. Это почти в полтора раза больше, чем было в конце 2021 года — а уже тогда число брошенных вагонов достигло пятилетнего максимума.

В компании остро не хватает локомотивных бригад. Ещё в начале января РЖД писали бодрые пресс-релизы о коллективном иммунитете среди сотрудников в 95%, но уже в феврале в холдинге заболевало по 2000 человек в сутки, а число заболевших превышало резерв в 2−3 раза. Полторы-две недели назад в РЖД на больничном находилось 25% машинистов.

→ К чему это приводит?
• На предприятия не поставляется критически важное для производства сырьё. Прямо сейчас есть риск остановки доменной печи на «Тулачермете» — одном из крупнейших в мире поставщиков товарного чугуна.

• Запасы сырья на предприятиях Промышленно-металлургического холдинга приближаются к критическому уровню, и если ситуация не выправится в ближайшее время, это может привести к остановке предприятий.

• На грани закрытия также и крупнейший в европейской части России специализированный угольный терминал «Ростерминалуголь».

• От нехватки составов и бригад страдают также «Роснефть», «Газпром нефть», «Уралхим».

• РЖД не принимает вовремя грузы, предприятия нарушают сроки поставки.

• Так, на Кузбассе сложилась «критическая ситуация» с вывозом угля — с начала февраля угледобывающие компании не смогли отправить 17,3 тыс. вагонов, или 1,2 млн тонн угля. Из-за этого склады угольных терминалов остаются без угля либо с минимальными запасами — из-за этого производители срывают обязательства, теряют доходы и рискуют «полностью утратить рынки сбыта».

• Чтобы компенсировать застрявшие в пути вагоны, операторам приходится посылать дополнительные и нести финансовые потери.

• Проблемы с простоем тянутся ещё с января — из-за этого, например, крупнейший производитель соли «Руссоль» уже в прошлом месяце не смог вывезти около 20% готовой соли: на путях рядом с месторождением соли простаивает до десяти поездов. Ситуация с каждым днём ухудшается, и задержки с отгрузкой технической и пищевой соли, как ожидается, могут затронуть потребителей по всей стране.

• Только на Московской железной дороге сейчас брошено 150 контейнерных поездов — терминалы их не принимают. Разобрать завалы не получается, перенаправлять поезда уже некуда, запасные терминалы уже тоже переполняются, а потери грузовладельцев оцениваются минимум в 5000₽ на контейнер в сутки.

Эксперты считают, что выправить ситуацию получится только в течение 2−3 месяцев — то количество поездов, которое сейчас брошено на сети, можно будет поднять только к лету. «Ситуация критическая».

«Сейчас очень многие болеют, серьёзно осложнена работа железнодорожного транспорта. Часто просто не хватает людей в депо, некому ремонтировать вагоны, работники не могут вовремя принять грузы. Просто налицо нехватка рабочих рук».

@dragan_covid

29.3k 9 220 239 160

Алексей Ракша сообщает про рост смертности в волну безобидного омикрона, от которого, как мы знаем благодаря Мясниковым и ко, совсем «не умирают», который «протекает очень легко» и с которым «в реанимацию не попадают».

В Москве за последнюю неделю смертность выросла на +66% по отношению к доковидной норме. Две недели назад прирост был +48%, три назад +35%, четыре недели назад (когда волна омикрона только разгонялась, а всю смертность давал спадающий хвост дельты) было +25%.

Что такое прирост смертности на 66%? Для февраля это около 1600 избыточных смертей в неделю, или 230 в сутки. Это совсем близко к пиковым показателям прошлых волн: начала мая 2020, рубежа июня-июля 2021, октября-ноября 2021.

И это — спустя два года эпидемии. При 83−85 тысяч избыточно умерших только в Москве. Очевидно, с внушительной иммунной прослойкой. Со свободным, почти неограниченным доступом к вакцине с декабря 2020 года (и при этом проваленной кампанией по вакцинации, особенно среди самых уязвимых: пожилых). При менее патогенном варианте, чем дельта.

И — как замечает Алексей — всё это при хвалёной московской медицине:

«То есть уровень развития медицины и избыточная смертность в эпоху Ковида не связаны (напомню, что накопленным итогом минимальна она в Тыве, на Чукотке, в Забайкалье, других регионах ДФО, кроме Якутии, в Псковской и Ивановской областях)».

Напомню: всю избыточную смертность московский депздрав в своих ежемесячных разборах связывал непосредственно с ковидом, а согласно отчётам Росстата, 95% избыточных смертей в Москве с апреля 2020 по декабрь 2021 — это смерти с ковидом. И та смертность, которую с начала эпидемии демонстрирует Москва, означает совсем простое. Каждые 10 человек из 35 умерших в Москве с апреля 2020 умерли в связи с ковидом.

Официальная смертность в Москве тем временем показывает традиционную полочку. Последние 10 дней в столице официально от ковида умирает строго от 81 до 86 человек в сутки (вернее, 86 было всего раз). Причём одно число повторяется не чаще, чем раз в 4-5 дней.

Как в московской статистке отразился скачок избыточной смертности в 2,5 раза? Официальная смертность выросла всего на 17%: по оперштабу, за последнюю неделю умерло 584 человека, тогда как четыре недели назад — 501. Избыточная же смертность выросла за этот же период от 600-700 человек в неделю до 1600-1650.

На сегодня, по оценкам Алексея, Россия перешагнула за 1 060 000 избыточных смертей (впрочем, по ряду других оценок, это произошло уже в январе). По стране в целом смертность также идёт в рост.

P.S. Интересно, какую избыточную смертность продемонстрирует Петербург, официально достигший 100% коллективного иммунитета — и где не менее официально от ковида умирает почти 500 человек в неделю, а оперштабовская смертность растёт.

@dragan_covid

50.3k 45 658 434 164

Госпитализации в России снижаются — причём снижение началось ещё до того, как это отразилось в статистике федерального оперштаба. Почему параллельно со спадом госпитализаций росла официальная заболеваемость, связано ли это с нехваткой коек, что происходит в российских реанимациях и правда ли с омикроном никто теперь не попадает на ИВЛ — обо всём в этом тексте.


Если вам кажется, что вокруг все болеют, вам не кажется.

Последние недели Россия живёт в состоянии «естественного локдауна». Даже если не вводить ограничения, они возникнут сами собой. Можно не принимать никаких мер и дать всем переболеть в надежде на то, что «мягкий» омикрон многие перенесут на ногах — но это не спасёт от непроизвольного локдауна, вынужденного и необъявленного.

Дороги пустые, пробок нет даже в часы пик, в транспорте мало людей, автобусы ходят с задержками, в метро увеличены интервалы.

На работу в какой-то момент не выходит по 20−30% сотрудников за раз.

В рестораны никто не ходит, концерты переносятся, театры закрыты на карантин, отменяются спортивные матчи и чемпионаты.

В МФЦ не хватает сотрудников, налоговые не ведут прием, в суды не попасть, болеют администрации городов, закрываются отделения банков.

В школах отсутствуют целые классы, учителей нет, не выходят повара и вахтёры.

В поликлиниках и больницах — ад.

Разобрался в статье для Republic, как Россия проживает естественный локдаун — и какие сферы жизни он затронул. Пейволл снят, статья открыта.

Из хороших новостей — Москва и часть регионов из естественного локдауна уже постепенно выходят.

22k 11 224 252 162

Репост из: Включил Зеленского
Мэрия Москвы, резко изменив формат отчёта о госпитализациях, не подумала, что делать, когда заражения спадут.

Делая вид, что заражения не так важны, московский оперштаб заменил главную часть ежедневной инфографики. Раньше там была ежедневная прибавка по заражениям.

Но с 22 января там появилась новая цифра, которая не имеет никакого смысла: количество новых госпитализаций за вчера, поделенное на количество заражений за вчера. В виде процента.

Очевидно, что не все (даже не большинство) госпитализации связаны со свежими заражениями. То есть делить надо неделя на неделю, да ещё со смещением. Но мэрию это не смутило, и они стали рисовать эти процентики.

До сегодняшнего дня. Потому что сегодня госпитализации остались на прежнем уровне, а вот заражения упали. А значит этот бессмысленный процент вырос. Очень вырос. И мэрия решила вообще ничего не рисовать.

График должен был бы выглядеть вот так 👆

18.9k 1 148 97 235

Казалось, российским предпринимателям не грозит «естественный локдаун», когда болеет так много людей, что становится некому работать. Казалось, что никаких массовых больничных не будет, сотрудники не будут выпадать, а все продолжат героически ходить на работу с температурой, соплями и кашлем (тем более что омикрон приобрёл славу безобидной ОРВИ).

Однако оказалось, что это не так.

Оказалось, что естественный локдаун — это очень неприятно.

Это когда трафик в ресторанах проседает на 40−50% оттого, что слишком многие болеют и сидят по домам.

Это когда в магазинах на больничном сразу 50% сотрудников (а из них с положительным ПЦР всего 5%, поэтому карантин, который так спешили отменить, здесь ни при чём).

Это когда клиенты отказываются от запланированных сделок из-за болезни.

Это когда нарушаются производственные планы, продажи обваливаются, бизнес простаивает и терпит убытки.

Всё это реальные примеры, и это происходит по всей России последние несколько недель. Подробнее о том, как российский бизнес переживает естественный локдаун — в этом тексте.

19.3k 10 146 149 115
Показано 20 последних публикаций.

7 161

подписчиков
Статистика канала