Итак, подтвердился новый штамм в бразильском Манаусе – том самом городе в Амазонии, где "все переболели" - якобы 76% населения к октябрю имело контакт с вирусом.
В штате Амазонас живет 4 миллиона, 2 из них могут добраться до Манауса, где есть стационары, только по рекам Риу-Негру и Амазонке, набившись в лодки. Город является зоной свободной торговли с международным аэропортом, что означает завоз штаммов извне: так, в Манаусе ранее обнаруживались 4 штамма SARS-CoV2 из Колумбии, Дании и Великобритании, которые не были идентифицированы больше нигде в Бразилии. А ещё в дождевых лесах Амазонии крупнейший анклав диких летучих мышей. Что могло пойти не так?
Первый случай инфекции в Манаусе был выявлен 13 марта. К концу апреля по официальным данным в штате умирало от ковида по 50 человек в день, но поскольку тестирование было ограниченным, а ковид часто классифицировался как респираторное заболевание, эксперты предполагают, что в штате было в 5 раз больше инфекций и в 2 раза больше смертей. Власти хоронили умерших в братских могилах.
Медсестра Франсинет Симоэнс из центра неотложной помощи при ковиде:
Многие люди не верили, что пандемия реальна. Манаус - это оплот избирателей президента Бразилии Жаира Болсонару, который неоднократно отвергал COVID-19 как «маленький грипп».
Эти же многие люди не верили, что ковид снова придёт в город, который так сильно пострадал от первой волны – особенно с учетом данных о 76% переболевших. Такими данными всех оптимистов обеспечили ученые, которые в погоне за славой часто не ведают, что творят.
Группа из Института тропической медицины Университета СанПаулу в сентябре выложила препринт исследования COVID-19 herd immunity in the Brazilian Amazon. Они протестировали на антитела пробы донорской крови, сданные в каждом месяце с февраля по август в Манаусе и Сан-Паулу. Опираясь на сомнительные методики расчета, авторы работы вывели доли переболевших по состоянию на август 66,1% для Манауса и 22,4% для Сан-Паулу (теоретический порог коллективного иммунитета при R0=2.5 они оценили в ~60%).
К декабрю они доработали исследование и выложили его с новым заголовком Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic и ещё более жизнеутверждающим выводом: С поправкой на случаи без определяемого уровня антител и на снижение титра антител со временем, мы оцениваем attack rate (долю переболевших) в 66% в июне и в 76% в октябре.
Некоторые эксперты говорили о том, что работа не выдерживает критики, что доноры крови с любыми математическими поправками не являются репрезентативной выборкой, что перспектива бесплатного тестирования на COVID-19 при сдаче крови побуждала к донорству именно переболевших и контактных, что центр крови сотрудничал с Uber и предлагал скидку донорам, едущим сдавать кровь, и вся эта аналитика ровным счетом никуда не годится – но дело было сделано: новости о коллективном иммунитете разошлись по городу, на их основе политики приняли решение об ослаблении ограничений, а население в одностороннем порядке объявило эпидемию оконченной, вернувшись в рестораны, на пляжи и рейвы.
По данным Brasil.io, на 1 сентября 2020 семидневное скользящее среднее для новых инфекций в штате Амазонас составляло 565. К 1 октября этот средний показатель вырос до 850.
Однако когда The Telegraph взял комментарий у заместителя главы департамента здравоохранения штата Амазонас доктора Талеса Шинкариола, тот объяснил, что второй волны нет и не ожидается:
В Амазонасе высокий уровень сопутствующих заболеваний, включая диабет и гипертонию, что усугубляет течение инфекции - не случайно, все четыре пациента, находящиеся сейчас в ОРИТ ковидного госпиталя Delphina Aziz страдают ожирением.
Разумеется, мне некомфортно от того, что вирус все еще в популяции, но исследования показывают, что две трети Манауса уже переболели. Мы не знаем точного порога коллективного иммунитета, но поскольку мы перешли 50% отметку, второй волны мы не ожидаем.
TBC⬇️
В штате Амазонас живет 4 миллиона, 2 из них могут добраться до Манауса, где есть стационары, только по рекам Риу-Негру и Амазонке, набившись в лодки. Город является зоной свободной торговли с международным аэропортом, что означает завоз штаммов извне: так, в Манаусе ранее обнаруживались 4 штамма SARS-CoV2 из Колумбии, Дании и Великобритании, которые не были идентифицированы больше нигде в Бразилии. А ещё в дождевых лесах Амазонии крупнейший анклав диких летучих мышей. Что могло пойти не так?
Первый случай инфекции в Манаусе был выявлен 13 марта. К концу апреля по официальным данным в штате умирало от ковида по 50 человек в день, но поскольку тестирование было ограниченным, а ковид часто классифицировался как респираторное заболевание, эксперты предполагают, что в штате было в 5 раз больше инфекций и в 2 раза больше смертей. Власти хоронили умерших в братских могилах.
Медсестра Франсинет Симоэнс из центра неотложной помощи при ковиде:
Многие люди не верили, что пандемия реальна. Манаус - это оплот избирателей президента Бразилии Жаира Болсонару, который неоднократно отвергал COVID-19 как «маленький грипп».
Эти же многие люди не верили, что ковид снова придёт в город, который так сильно пострадал от первой волны – особенно с учетом данных о 76% переболевших. Такими данными всех оптимистов обеспечили ученые, которые в погоне за славой часто не ведают, что творят.
Группа из Института тропической медицины Университета СанПаулу в сентябре выложила препринт исследования COVID-19 herd immunity in the Brazilian Amazon. Они протестировали на антитела пробы донорской крови, сданные в каждом месяце с февраля по август в Манаусе и Сан-Паулу. Опираясь на сомнительные методики расчета, авторы работы вывели доли переболевших по состоянию на август 66,1% для Манауса и 22,4% для Сан-Паулу (теоретический порог коллективного иммунитета при R0=2.5 они оценили в ~60%).
К декабрю они доработали исследование и выложили его с новым заголовком Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic и ещё более жизнеутверждающим выводом: С поправкой на случаи без определяемого уровня антител и на снижение титра антител со временем, мы оцениваем attack rate (долю переболевших) в 66% в июне и в 76% в октябре.
Некоторые эксперты говорили о том, что работа не выдерживает критики, что доноры крови с любыми математическими поправками не являются репрезентативной выборкой, что перспектива бесплатного тестирования на COVID-19 при сдаче крови побуждала к донорству именно переболевших и контактных, что центр крови сотрудничал с Uber и предлагал скидку донорам, едущим сдавать кровь, и вся эта аналитика ровным счетом никуда не годится – но дело было сделано: новости о коллективном иммунитете разошлись по городу, на их основе политики приняли решение об ослаблении ограничений, а население в одностороннем порядке объявило эпидемию оконченной, вернувшись в рестораны, на пляжи и рейвы.
По данным Brasil.io, на 1 сентября 2020 семидневное скользящее среднее для новых инфекций в штате Амазонас составляло 565. К 1 октября этот средний показатель вырос до 850.
Однако когда The Telegraph взял комментарий у заместителя главы департамента здравоохранения штата Амазонас доктора Талеса Шинкариола, тот объяснил, что второй волны нет и не ожидается:
В Амазонасе высокий уровень сопутствующих заболеваний, включая диабет и гипертонию, что усугубляет течение инфекции - не случайно, все четыре пациента, находящиеся сейчас в ОРИТ ковидного госпиталя Delphina Aziz страдают ожирением.
Разумеется, мне некомфортно от того, что вирус все еще в популяции, но исследования показывают, что две трети Манауса уже переболели. Мы не знаем точного порога коллективного иммунитета, но поскольку мы перешли 50% отметку, второй волны мы не ожидаем.
TBC⬇️