Что такое quality и overall quality, которые у нас приведены для каждого молекулы и спектра в системе?
Это внутренние метрики адекватности описания молекулы.
Quality - это параметр, показывающий насколько данный конкретный спектр соответствует данной конкретной молекуле (характеризует связку молекула-спектр-статья).
Overall quality - это параметр, показывающий насколько совокупное описание данной молекулы в данной статье адекватно (характеризует связку молекула-статья).
Рассмотрим на примере (картинка). Допустим, в какой-то статье авторы синтезировали п-анизидин и стали описывать его спектры.
Как видно из структуры, анизидин должен дать 5 сигналов в 13С ЯМР. Если все пять сигналов реально есть, и их положения сходятся с ожидаемым, исходя из предсказаний, а также с положениями сигналов на спектрах анизидина в других статьях, то quality будет высоким.
Если же авторы потеряли несколько сигналов, или они плохо сходятся по положениям с ожидаемым - quality упадет.
Теперь расширим пример (картинка). Есть две статьи. В одной для уже упомянутого анизидина есть 1Н ЯМР, 13С ЯМР, HRMS, температура плавления, и все это соответствует заявленной структуре и другим спектрам того же анизидина. То есть, существует много спектров, у каждого из которых высокое quality. Это приведет к тому, что overall quality описания анизидина в данной статье также будет высоким. Во второй статье авторы решили, что молекула известная, и привели только один 1Н ЯМР спектр. Спектр хороший, соответствует структуре, его quality высокое. Но он только один, в результате overall quality характеризации анизидина в данной статье будет низким. Так как, при прочих равных, мы явно больше верим авторам, которые зарегистрировали 5 спектров одной молекулы, по сравнению с авторами, показавшими только один спектр.
Это только поверхностное описание - в реальности в данные параметры зашита более хитрая логика.
Как этим пользоваться на практике?
- Чем выше quality и overall quality - тем лучше). И тот и тот параметр выше 70% считается хорошим
- Overall quality в общем случае важнее quality. Для какой-то молекулы может быть плохо описан один из спектров, но наличие еще трех сошедшихся перевесит и подтвердит, что авторы синтезировали именно то, что заявили.
- Думайте головой и перепроверяйте первоисточник в сомнительных случаях) Как - в другом посте.
Это внутренние метрики адекватности описания молекулы.
Quality - это параметр, показывающий насколько данный конкретный спектр соответствует данной конкретной молекуле (характеризует связку молекула-спектр-статья).
Overall quality - это параметр, показывающий насколько совокупное описание данной молекулы в данной статье адекватно (характеризует связку молекула-статья).
Рассмотрим на примере (картинка). Допустим, в какой-то статье авторы синтезировали п-анизидин и стали описывать его спектры.
Как видно из структуры, анизидин должен дать 5 сигналов в 13С ЯМР. Если все пять сигналов реально есть, и их положения сходятся с ожидаемым, исходя из предсказаний, а также с положениями сигналов на спектрах анизидина в других статьях, то quality будет высоким.
Если же авторы потеряли несколько сигналов, или они плохо сходятся по положениям с ожидаемым - quality упадет.
Теперь расширим пример (картинка). Есть две статьи. В одной для уже упомянутого анизидина есть 1Н ЯМР, 13С ЯМР, HRMS, температура плавления, и все это соответствует заявленной структуре и другим спектрам того же анизидина. То есть, существует много спектров, у каждого из которых высокое quality. Это приведет к тому, что overall quality описания анизидина в данной статье также будет высоким. Во второй статье авторы решили, что молекула известная, и привели только один 1Н ЯМР спектр. Спектр хороший, соответствует структуре, его quality высокое. Но он только один, в результате overall quality характеризации анизидина в данной статье будет низким. Так как, при прочих равных, мы явно больше верим авторам, которые зарегистрировали 5 спектров одной молекулы, по сравнению с авторами, показавшими только один спектр.
Это только поверхностное описание - в реальности в данные параметры зашита более хитрая логика.
Как этим пользоваться на практике?
- Чем выше quality и overall quality - тем лучше). И тот и тот параметр выше 70% считается хорошим
- Overall quality в общем случае важнее quality. Для какой-то молекулы может быть плохо описан один из спектров, но наличие еще трех сошедшихся перевесит и подтвердит, что авторы синтезировали именно то, что заявили.
- Думайте головой и перепроверяйте первоисточник в сомнительных случаях) Как - в другом посте.