Новости науки от Елены
Известно, что мутации - одна из движущих сил возникновения опухоли. Нам известно множество генов, мутации в которых ломают стоп-сигналы, делают опухоль неуправляемой, ломают системы починки и контроля правильности последовательности ДНК. Однако мутация мутации рознь. Некоторые мутации проходят почти бесследно, а некоторые требуют пристального внимания. Но как отличить повреждающие мутации от тех, на которые можно не обращать внимание? У исследователей есть много техник, и одна из них - насыщающий мутагенез. Мы берем рабочую копию гена, и меняем в ней все нуклеотиды прдряд так, чтобы изменилась аминокислота в белке - стала другой или белок вообще прервался. Т.е. насыщаем мутациями всю прследовательность изучаемого гена. Затем каждую конструкцию внедряем в клетку и смотрим, как мутированный белок повлиял на скорость деления, жизнеспособность клеток и т.д. Т.е. мы можем проверить в одном масштабе эффект почти каждой возможной мутации.
Ранее такую технику уже применили к двум генам BRCA1 и BRCA2. Они известны своим вкладом в рак груди, яичников, простаты. Мутацию в гене BRCA1 Ажелина Джоли унаследовала от своей матери, имевшей рак груди и яичников.
И вот недавно появилась статья, в которой исследователи обнародовали результаты насыщающего мутагенеза с помощью геномного редактирования для двух новых генов - 5412 мутаций в гене RAD51D и 3743 мутации в гене XRCC2. Исследователям не только удалось проверить повреждающий эффект этих мутаций. Но и выявить, что часть мутаций мешает правильной склейке (сплайсингу) частей гена. И этот эффект повреждения сплайсинга не получается предсказать самым известным инструментом для этого SpliceAI. Так же была выявлена разная чувствительность этих двух генов к мутациям, укорачивающим белок.
Эти результаты помогут генетикам и онкологам точнее предсказывать влияние мутаций опухоли конкретного пациента на эффективность лечения. Так же это поможет выстраивать траекторию наблюдения в семьях с наследственными мутациями в этих генах.
Известно, что мутации - одна из движущих сил возникновения опухоли. Нам известно множество генов, мутации в которых ломают стоп-сигналы, делают опухоль неуправляемой, ломают системы починки и контроля правильности последовательности ДНК. Однако мутация мутации рознь. Некоторые мутации проходят почти бесследно, а некоторые требуют пристального внимания. Но как отличить повреждающие мутации от тех, на которые можно не обращать внимание? У исследователей есть много техник, и одна из них - насыщающий мутагенез. Мы берем рабочую копию гена, и меняем в ней все нуклеотиды прдряд так, чтобы изменилась аминокислота в белке - стала другой или белок вообще прервался. Т.е. насыщаем мутациями всю прследовательность изучаемого гена. Затем каждую конструкцию внедряем в клетку и смотрим, как мутированный белок повлиял на скорость деления, жизнеспособность клеток и т.д. Т.е. мы можем проверить в одном масштабе эффект почти каждой возможной мутации.
Ранее такую технику уже применили к двум генам BRCA1 и BRCA2. Они известны своим вкладом в рак груди, яичников, простаты. Мутацию в гене BRCA1 Ажелина Джоли унаследовала от своей матери, имевшей рак груди и яичников.
И вот недавно появилась статья, в которой исследователи обнародовали результаты насыщающего мутагенеза с помощью геномного редактирования для двух новых генов - 5412 мутаций в гене RAD51D и 3743 мутации в гене XRCC2. Исследователям не только удалось проверить повреждающий эффект этих мутаций. Но и выявить, что часть мутаций мешает правильной склейке (сплайсингу) частей гена. И этот эффект повреждения сплайсинга не получается предсказать самым известным инструментом для этого SpliceAI. Так же была выявлена разная чувствительность этих двух генов к мутациям, укорачивающим белок.
Эти результаты помогут генетикам и онкологам точнее предсказывать влияние мутаций опухоли конкретного пациента на эффективность лечения. Так же это поможет выстраивать траекторию наблюдения в семьях с наследственными мутациями в этих генах.