АгроГеном


Гео и язык канала: Россия, Русский
Категория: Природа


Канал от РСХБ о генетике растений, животных и новых биотехнологиях. Разбираем ДНК-редактирование, селекционные прорывы и будущее сельского хозяйства.
Сайт: https://ventures.rshbdigital.ru
Контакт: @mitkovskay Юлия

Связанные каналы

Гео и язык канала
Россия, Русский
Категория
Природа
Статистика
Фильтр публикаций


🌱 Как биореакторы и растения начинают конкурировать за производство лекарств

🌾Лекарственный белок можно производить не только в промышленном биореакторе. Для некоторых препаратов в качестве «биофабрики» используют растения: их клетки заставляют синтезировать нужный белок, после чего его выделяют и очищают.

🧬 Биореакторы обычно используют клетки бактерий, дрожжей или млекопитающих. Клетки выращивают в строго контролируемых условиях, регулируя температуру, pH, питание и другие параметры. Особенно хорошо такие системы подходят для сложных белков, структура которых зависит от процессов внутри клеток млекопитающих.

🌱 У растений есть другое преимущество. Их можно выращивать относительно дешево и масштабировать производство за счет увеличения площади выращивания. Кроме того, некоторые растения способны быстро нарабатывать большое количество рекомбинантного белка.


➕ Уже существуют реальные примеры такого подхода. Наиболее известный пример именно растительного производства вакцины — Medicago’s Covifenz, первой растительной вакцины против COVID-19, получившей разрешение на применение в Канаде в 2022 году. Это показало, что растительная платформа может пройти путь от биотехнологической разработки до зарегистрированного медицинского продукта.

💬 Но растения пока не вытеснили биореакторы. Фармацевтическое производство требует очень стабильного состава продукта, воспроизводимости, высокой степени очистки и строгого контроля качества. Для некоторых белков растительные клетки также по-другому выполняют посттрансляционные модификации, поэтому приходится специально настраивать систему.

@agrogenom
#фармацевтика


🧬Почему не все полезные мутации приживаются в селекции

💬 Можно найти мутацию, которая повышает урожайность, устойчивость к засухе или сопротивляемость болезни, — и всё равно не получить на её основе хороший сорт. Причина в том, что один генетический вариант может одновременно влиять сразу на несколько признаков.

🌱 Это называют плейотропией. Например, мутация может повышать устойчивость растения к определённому стрессу, но одновременно замедлять рост или снижать репродуктивную способность. Если отрицательный эффект оказывается достаточно сильным, селекционер не сможет просто «взять» полезный признак — вместе с ним придётся унаследовать и нежелательное изменение.

🌾 Есть и другая проблема — генетическое сцепление. Нужный вариант может находиться рядом с другим участком ДНК, который связан с нежелательным признаком. При скрещивании они могут передаваться вместе. Такое явление называют linkage drag, или генетическим «балластом». Особенно сложно избавиться от него, если между участками редко происходят рекомбинации.

💻 Наконец, эффект мутации зависит от генетического фона. Один и тот же вариант может давать сильный положительный эффект в одном сочетании генов и гораздо меньший — в другом. Такие взаимодействия называют эпистазом. Поэтому результат, который получили в одной селекционной линии, не всегда можно напрямую перенести в другую.

▶️ Поэтому современная селекция ищет не просто «полезные мутации», а удачные комбинации генов. Геномный анализ помогает определить, где находится нужный вариант, с какими участками он сцеплён и как его эффект проявляется в разных генетических фонах.

@agrogenom
#генетика


🧬Почему комплексная защита растений эффективнее одного метода

👨‍🌾 Представим поле, на котором появился вредитель. Можно сразу применить инсектицид — и численность насекомых резко снизится. Но если рассчитывать только на один способ защиты, со временем возникают новые проблемы: вредители могут вырабатывать устойчивость, а после уничтожения естественных врагов иногда происходит повторный рост их численности. Поэтому в современной защите растений используют интегрированный подход.

🌱 Интегрированная защита растений (IPM) объединяет разные методы: устойчивые сорта, севооборот, мониторинг вредителей, биологический контроль, механические способы и, при необходимости, химические препараты. При этом задача заключается не в полном уничтожении всех вредных организмов, а в удержании их численности ниже уровня, при котором они начинают наносить существенный экономический ущерб.

▶️ Почему сочетание работает лучше? Методы могут дополнять друг друга. Например, устойчивый сорт снижает восприимчивость культуры, естественные враги регулируют численность вредителей, а химическая обработка применяется только тогда, когда мониторинг показывает реальную необходимость. За счёт этого нагрузка не ложится на один инструмент. Исследования принципов IPM показывают, что даже методы, которые по отдельности дают более слабый эффект, в комбинации могут обеспечивать значимое снижение вредителей.

💬 Есть и эволюционная причина. Если один и тот же препарат регулярно используется против популяции, устойчивые особи получают преимущество и постепенно становятся более распространёнными. Комбинация методов позволяет снизить интенсивность этого отбора и уменьшить зависимость от одного механизма действия. Поэтому управление устойчивостью — один из ключевых элементов интегрированной защиты.

➕ При комплексной защите сначала оценивают ситуацию в поле, определяют экономический порог вредоносности и выбирают подходящие методы в зависимости от культуры, вредителя и условий сезона. Именно сочетание мониторинга, профилактики и точечного воздействия делает систему более устойчивой.

@agrogenom
#защита_растений


Почему невозможно создать одну «идеальную» муку для всех продуктов?
Опрос
  •   Разные продукты требуют разных свойств муки
  •   Генетика не влияет на свойства зерна
  •   Свойства зерна определяются условиями хранения
5 голосов


Какие вещества микроорганизмы образуют во время ферментации и которые влияют на вкус и аромат?
Опрос
  •   Кислоты, альдегиды и другие метаболиты
  •   Кислоты, эфиры, альдегиды, этанол, углекислый газ и другие метаболиты
  •   Кислоты, спирты, эфиры, альдегиды и другие метаболиты
4 голосов


Почему изменение цвета продукта может повлиять на восприятие его вкуса?
Опрос
  •   Цвет напрямую изменяет работу вкусовых рецепторов
  •   Зрительная информация формирует ожидания о вкусе и аромате
  •   Яркие продукты содержат больше вкусовых соединений
4 голосов


🌱 Пятничная викторина уже здесь!

➕ Сегодня — три вопроса про #фудтех.

Темы:
🟢 Почему цвет продукта влияет на его восприятие — читать здесь
🟢 Как ферментация меняет вкус без искусственных добавок— читать здесь
🟢 Можно ли создать идеальную муку с помощью генетики?— читать здесь

⬆️ Правильные ответы уже есть в предыдущих постах — найти их можно через хэштег и материалы канала.

#викторина
#фудтех


🌾Почему биоразнообразие насекомых важно для урожая

🐄 Когда говорят о пользе насекомых для сельского хозяйства, чаще всего вспоминают пчёл. Но на поле работает гораздо более сложная система: одни насекомые опыляют растения, другие охотятся на вредителей, третьи участвуют в разложении органики. Вместе они поддерживают процессы, от которых зависит продуктивность агроэкосистем.

🌱 Опылители напрямую влияют на формирование урожая многих культур. Пчелы, шмели, мухи, бабочки и другие насекомые переносят пыльцу между цветками. Для ряда плодовых, овощных и семенных культур качество и количество урожая зависят от того, насколько эффективно происходит опыление. Причём важна не только численность опылителей, но и их разнообразие: разные виды активны при разных температурах и погодных условиях, поэтому разнообразное сообщество может обеспечивать более стабильное опыление.

👨‍🌾 Но насекомые помогают урожаю и другим способом. Божьи коровки, златоглазки, хищные клопы, паразитоидные осы и другие естественные враги сокращают численность вредителей. Чем разнообразнее такое сообщество, тем больше экологических механизмов одновременно работает против вспышек вредных организмов. FAO рассматривает биологический контроль вредителей и опыление как ключевые экосистемные услуги, поддерживающие сельскохозяйственное производство.

🗒 Поэтому исчезновение насекомых может отражаться на урожае сразу по нескольким направлениям: становится меньше опылителей, ослабевает естественный контроль вредителей и нарушаются пищевые связи внутри агроэкосистемы. При этом связь не всегда линейна: вклад каждого вида зависит от культуры, региона, погоды и способов ведения хозяйства.

➕ Сохранение насекомых на сельхозтерриториях — это не просто отказ от уничтожения «полезных жуков». Речь идет о создании условий, в которых разнообразные сообщества могут существовать: сохранении цветущих участков и мест обитания, поддержании разнообразия растений и грамотном применении средств защиты. Такой подход помогает одновременно поддерживать экосистемные функции и устойчивость производства.

@agrogenom
#насекомые


🐄 Почему цвет продукта влияет на его восприятие

👨‍🌾 Мы начинаем оценивать еду еще до первого кусочка. Цвет помогает мозгу предположить, каким будет вкус, аромат и даже свежесть продукта. Поэтому один и тот же продукт, окрашенный по-разному, может восприниматься совершенно иначе.

🌾 Цвет создает ожидания. Красный и розовый часто связываются со сладостью и спелостью, зелёный — со свежестью и кислинкой, а жёлтый и оранжевый — с фруктовыми и цитрусовыми вкусами. Эти ассоциации формируются из прошлого опыта и влияют на то, как мы воспринимаем вкус.

💻 Мозг объединяет зрение и вкус. Исследования показывают, что цвет способен менять субъективную оценку вкуса и интенсивности аромата, даже когда состав продукта остаётся одинаковым. Особенно заметен эффект, если цвет не совпадает с привычными ожиданиями.

▶️ Поэтому в фудтехе цвет — это не только вопрос внешнего вида. Производители используют натуральные и синтетические красители, чтобы сделать продукт визуально привлекательнее, подчеркнуть ожидаемый вкус или сохранить привычный цвет после изменения рецептуры.

🐟 Вкус начинается ещё до того, как еда оказывается во рту. Сначала продукт «пробуют» глазами, а уже потом рецепторами.

#фудтех


➕ Почему состав микробиома меняется вместе с климатом

💬 Микроорганизмы не живут в вакууме — температура, влажность и доступность пищи напрямую определяют, какие виды смогут расти и конкурировать между собой. Поэтому изменения климата может постепенно перестраивать целые микробные сообщества.

➕ Температура. У разных микроорганизмов свои температурные оптимумы. При потеплении одни виды получают преимущество, другие становятся менее активными. Эксперименты на разных растениях и животных показали, что изменение температуры действительно меняет разнообразие и состав микробиомов.

🗒 Вода и осадки. Засухи, ливни и изменение режима таяния снега меняют влажность почвы, доступность питательных веществ и условия для микроорганизмов. Например, более раннее таяние снега в альпийских экосистемах уже связывают с изменением состава почвенного микробиома и процессов круговорота углерода и азота.

🌱 Изменяется и «еда» микробов. Климат влияет на растения, их рост и химический состав органического вещества, которое попадает в почву. А значит, меняется и набор ресурсов, доступных бактериям и грибам.

#микромир


💻 Что такое селекционный индекс и почему одного признака недостаточно

👨‍🌾 Представим, что селекционеру нужно выбрать растения для следующего поколения. Одно даёт высокий урожай, другое лучше переносит засуху, третье устойчиво к болезни, а четвёртое отличается хорошим качеством зерна. Как выбрать лучшие растения, если важны сразу несколько характеристик?

🧬 Здесь используют селекционный индекс — способ объединить информацию о нескольких признаках в один показатель. Для каждого признака задают определённый вес в зависимости от его значения для будущего сорта, а затем рассчитывают суммарный индекс. Чем выше результат, тем интереснее кандидат для дальнейшей селекции.

🌱 Например, при создании засухоустойчивого сорта можно одновременно учитывать урожайность, устойчивость к недостатку воды, сроки созревания и качество продукции. Растение с максимальной урожайностью не обязательно окажется лучшим: если оно сильно теряет урожай при засухе, его итоговый индекс может быть ниже, чем у растения с немного меньшей урожайностью, но более стабильным результатом.

💻 Современная селекция позволяет учитывать ещё больше информации. В индекс могут включаться данные фенотипирования, маркеров ДНК и геномной селекции. Это помогает оценивать растения комплексно и выбирать те сочетания признаков, которые соответствуют конкретной селекционной цели.

➕ При этом универсального селекционного индекса не существует. Его состав и веса зависят от культуры, региона, условий выращивания и того, каким должен быть будущий сорт.

@agrogenom
#селекция


Почему модель ИИ может хорошо работать в одном регионе и ошибаться в другом?
Опрос
  •   Алгоритм постепенно теряет точность после обучения
  •   В разных регионах растения растут с одинаковой скоростью, поэтому данные менее информативны
  •   Условия могут отличаться от тех, на которых модель обучалась
1 голосов


Почему компьютерному зрению бывает сложно определить причину пожелтения листа?
Опрос
  •   Один и тот же визуальный признак может возникать по разным причинам
  •   Нейросеть не может анализировать цвет листьев
  •   Болезни растений выглядят слишком схоже для компьютерного зрения
1 голосов


Какие данные могут использоваться для прогноза урожайности?
Опрос
  •   Только спутниковые для посевов
  •   Спутниковые данные, погода, характеристики почвы и данные о выращивании
  •   Только данные о количестве осадков
1 голосов


🌱 Пятничная викторина уже здесь!

➕ Сегодня — три вопроса про #ИИ и его применение в сельском хозяйстве.

🌾Темы:
🟢Можно ли предсказать урожай за несколько месяцев до уборки? — читать здесь
🟢Как компьютерное зрение отличает болезнь от нехватки питания — читать здесь
🟢Почему искусственный интеллект ошибается при анализе урожая — читать здесь

⬆️ Правильные ответы уже есть в предыдущих постах — найти их можно через хэштег и материалы канала.

@agrogenom
#викторина #ИИ


🌾Можно ли выращивать лекарства в теплице круглый год?

👨‍🌾 Растения уже давно рассматривают не только как источник сырья, но и как биологические фабрики. С помощью молекулярной фарминги им можно придать генетическую конструкцию, благодаря которой клетки начинают производить нужный белок — например, вакцинный антиген, антитело или терапевтический белок.

🌱 Для этого используют, в частности, Nicotiana benthamiana — близкого родственника табака. В растение временно вводят генетическую конструкцию, после чего оно начинает синтезировать нужный белок. Затем растительную массу собирают, выделяют целевой продукт и очищают его уже по фармацевтической технологии. Такой подход позволяет получать белки значительно быстрее, чем при создании стабильных трансгенных линий.

💬 А что насчет круглогодичного производства? Здесь как раз помогают теплицы и другие контролируемые системы выращивания. Можно управлять температурой, освещением, влажностью, питанием и продолжительностью вегетации — и тем самым получать предсказуемую биомассу независимо от сезона. Для молекулярной фарминги применяют также закрытые indoor-системы, вертикальные установки и культуры растительных клеток.

➕ Но растение — только первая часть производства. Для лекарственного препарата необходимо контролировать концентрацию и структуру полученного белка, очистить его от растительных компонентов и подтвердить соответствие требованиям качества. Именно поэтому современные разработки всё чаще используют строго контролируемые системы, включая культуры растительных клеток, которые объединяют преимущества растений с возможностью промышленного контроля.

▶️ Получается, круглогодичная «фармацевтическая теплица» вполне возможна, но правильнее говорить о выращивании растений, которые производят лекарственные молекулы. Сам препарат появляется только после целой цепочки биотехнологических и фармацевтических процессов.

@agrogenom
#фармацевтика


🧬Можно ли совместить высокую урожайность и сохранение экосистем?

👨‍🌾 Долгое время сельское хозяйство развивалось по принципу: чтобы получить больше урожая с гектара, нужно сильнее контролировать окружающую среду — вносить удобрения, применять пестициды, орошать и максимально упрощать агроландшафт. Но у такого подхода есть обратная сторона: деградация почв, загрязнение воды и сокращение биоразнообразия могут со временем снижать устойчивость самой сельскохозяйственной системы.

👫 Выход ищут в экологической интенсификации. Её идея — использовать процессы, которые уже работают внутри экосистемы. Опылители повышают продуктивность культур, хищные насекомые регулируют численность вредителей, почвенные микроорганизмы участвуют в круговороте питательных веществ, а разнообразие культур помогает поддерживать устойчивость агроэкосистем.

🌾 На практике это может означать севообороты, покровные культуры, смешанные посевы, интегрированную защиту растений, сохранение участков естественной растительности и более точное использование воды и удобрений. Такие методы позволяют одновременно работать с урожайностью и состоянием экосистемы — например, за счёт естественного контроля вредителей и улучшения состояния почвы.

▶️ Но здесь нет простого правила «больше биоразнообразия = больше урожая». Анализ 43 исследований в 18 странах показал, что при диверсификации сельского хозяйства сочетание выигрыша и для биоразнообразия, и для урожайности наблюдалось примерно в 23% случаев. Результат сильно зависел от культуры, климата и конкретных методов ведения хозяйства.

@agrogenom
#экология


🧬 Как РНК-технологии помогают защищать культуры

➕ У растения, насекомого и грибка есть общий принцип работы генов: ДНК хранит информацию, а РНК помогает превращать её в работающие белки. Если искусственно вмешаться в этот процесс, можно выключить конкретный ген — например, тот, который необходим вредителю для развития или патогену для заражения растения.

🌱 Такой механизм называется РНК-интерференцией (RNAi). Учёные создают двухцепочечную РНК (dsRNA), последовательность которой соответствует нужному участку генетического материала. В клетке она расщепляется на небольшие фрагменты — siRNA, которые направляют клеточный комплекс к соответствующей матричной РНК. В результате производство нужного белка подавляется.

👫 Особенно интересно, что для этого необязательно создавать генетически модифицированное растение. При spray-induced gene silencing (SIGS) dsRNA можно нанести непосредственно на листья. Молекулы могут попасть в клетки растения и передаться взаимодействующему с ним организму либо поглощаться самим вредителем или патогеном. Так исследователи пытаются воздействовать на насекомых, грибковые заболевания, вирусы и нематод.

▶️ Главное преимущество подхода — последовательностная специфичность. Теоретически можно подобрать РНК под ген конкретного вредителя и минимизировать воздействие на организмы, у которых такой последовательности нет. Но технология пока сталкивается с практическими ограничениями: РНК легко разрушается под действием окружающей среды, её нужно эффективно доставить к клеткам-мишеням, а результаты полевых испытаний могут быть менее стабильными, чем в лаборатории.

➕ Поэтому РНК-технологии рассматривают прежде всего как новый инструмент защиты растений, который можно сочетать с другими методами. В 2026 году исследователи уже говорят о переходе RNAi-биопестицидов от стадии proof of concept к практическому применению, хотя вопросы эффективности, стоимости, регулирования и экологической безопасности всё ещё остаются предметом исследований.

@agrogenom
#защита_растений


👨‍🌾 Можно ли предсказать урожай за несколько месяцев до уборки?

💬 Оказывается, ждать уборки для оценки будущего урожая необязательно. Уже во время вегетации можно собирать данные о состоянии посевов и на их основе рассчитывать предполагаемую урожайность.

💻 Один из главных источников информации — спутниковые снимки. По ним отслеживают состояние растений и рассчитывают вегетационные индексы, например NDVI и LAI. К этим данным добавляют температуру, осадки, влажность, характеристики почвы и иногда информацию о технологии выращивания. Затем модели машинного обучения ищут связи между этими параметрами и фактической урожайностью прошлых лет.

🗒 Чем больше данных получает модель по ходу сезона, тем точнее обычно становится прогноз. Но предсказать урожай за несколько месяцев до уборки значительно сложнее, чем за несколько недель: впереди ещё могут произойти засуха, жара, избыток осадков, вспышка болезни или другие события, которые изменят развитие растений. Поэтому ранний прогноз — это прежде всего оценка вероятного урожая с определённой погрешностью, а не точное число.

🌱 Сегодня для таких задач используют Random Forest, CNN, LSTM и другие модели, а также комбинируют машинное обучение с моделями роста растений. Современные системы всё чаще объединяют спутниковые данные, погоду и информацию о почве — так прогноз получается устойчивее, чем при использовании одного источника.

@agrogenom
#ИИ


Что именно позволяет ускоренной селекции быстрее проходить путь от скрещивания до перспективного кандидата?
Опрос
  •   Ускорение жизненного цикла растений и возможность проводить более ранний генетический отбор
  •   Использование только лабораторных условий вместо выращивания растений в поле
  •   Отбор растений исключительно по внешнему виду до начала генетического анализа
2 голосов

Показано 20 последних публикаций.