Оказывается, такая проверка есть в нашем любимом CAM350. Запускаем продвинутые проверки DFM Streams. Вводим толщину трафарета в поле Stencil Thickness. Задаем магические соотношения по IPC:
Paste Mask Pad Aspect Ratio
Paste Mask Pad Area Ratio
Paste Minimum Width
Подсовываем слой гербера PasteTop и PasteBot на проверку. Вуаля - все негодные апертуры - в отчете, можно посмотреть и поправить групповым способом.