Пока вы весь прошлый год, тихо офигевая, читали свои новостные ленты, SARS-CoV-2 продолжил эволюционировать в тени медийного внимания, главным образом за счет дрейфа внутри ветви JN.1 и периодических событий рекомбинации. Я решил проанализировать помесячную динамику циркуляции линий вируса в Европе и России по данным базы GISAID с 1 января по 31 декабря 2025 года.

Вкратце о результатах: в Европе первый квартал 2025 характеризовался большим количеством конкурирующих линий без устойчивой доминанты: заметную долю имел рекомбинант XEC, но параллельно циркулировало множество субвариантов JN.1-кластера. Во втором полугодии европейский профиль резко унифицировался за счёт быстрого роста рекомбинанта XFG Стратус и его многочисленных субвариантов; NB.1.8.1 также присутствовал в данных эпиднадзора, но в небольших количествах. В России же в первом полугодии картина была иной: выраженная локальная волна LF.7.1.3 и родственных линий сменилась почти полным доминированием XFG-кластера к лету-осени.

То, что начиналось как небольшая заметка, в итоге скушало три недели и превратилось в грандиозную по размерам статью, которую я разместил по ссылке ниже. Надеюсь, вам будет интересно.

Как я указал во введении, данная работа идейно продолжает мои более ранние заметки Кухонная молекулярка: омикрон в России и Дети омикрона, которые также могут быть интересными.

Приобщиться: https://teletype.in/@getout_ofme/sarscov2_evo_dynamics