Репост из: Ivan Begtin
Научные данные России: с чего начинать
Земля, океан, климат
ЕСИМО — http://esimo.ru
Тема: океан, метеорология, гидрология.
Ценность: единая государственная система Росгидромета об обстановке в Мировом океане — официальный контур морских и гидрометеоданных, а не институтский архив.
Всемирный центр данных по метеорологии (Обнинск) — http://meteo.ru/mcd/ewdcmet.html
Тема: метеорология.
Ценность: российский узел сети World Data Centres: сбор и распространение метеоданных внутри страны и в международном обмене (ВНИИГМИ–МЦД).
Всемирный центр радиационных данных (WRDC) — http://wrdc.mgo.rssi.ru/
Тема: климат, солнечная радиация.
Ценность: один из шести мировых центров программы GAW ВМО; архив актинометрических наблюдений ГГО им. Воейкова.
Всемирный центр данных по солнечно-земной физике (Москва) — http://www.wdcb.ru/stp/index.en.html
Тема: геофизика, космос.
Ценность: архив наблюдений солнечно-земной физики Геофизического центра РАН.
Геомагнитный центр ГЦ РАН — https://geomag.gcras.ru/
Тема: геомагнетизм.
Ценность: данные обсерваторий INTERMAGNET по России и ближнему зарубежью, плюс спутниковые продукты (система MAGNUS).
Астрономия и физика
Центр астрономических данных ИНАСАН — https://www.inasan.ru/en/divisions/dpss/cad/
Тема: астрономия.
Ценность: с 1980 года российский филиал CDS Strasbourg; каталоги звёзд, переменных и двойных систем для отечественной астрономии.
SPECTR-W3 — http://spectr-w3.snz.ru/index.phtml
Тема: атомная спектроскопия, физика плазмы.
Ценность: одна из крупнейших баз по спектрам атомов и высокозарядных ионов (РФЯЦ–ВНИИТФ): уровни, линии, вероятности переходов, сечения.
Биоразнообразие и коллекции
Российский GBIF IPT — http://gbif.ru:8080/ipt/
Тема: биоразнообразие.
Ценность: национальный узел публикации occurrence-данных в GBIF (ИМПБ РАН / ИПМ им. Келдыша).
«Ноев ковчег», МГУ — https://depo.msu.ru/ipt/
Тема: живые системы, биоматериалы.
Ценность: депозитарий МГУ — от молекул до организмов; наборы публикуются в GBIF.
IPT ЗИН РАН и БИН РАН — https://ipt.zin.ru
Тема: зоология и ботаника.
Ценность: данные крупнейших академических коллекций — Зоологического и Ботанического институтов РАН.
IPT Института океанологии им. Ширшова — https://gbif.ocean.ru/ipt/
Тема: морская биология.
Ценность: встречи, плотность и биомасса видов с экспедиций ИО РАН.
Молекулярная биология (российские базы мирового уровня)
CSDB — https://csdb.glycoscience.ru/database/
Тема: гликомика.
Ценность: курируемая база природных углеводных структур с таксономией, литературой и ЯМР (ИОХ РАН).
GTRD — https://gtrd.biouml.org/
Тема: регуляция транскрипции.
Ценность: сайты связывания транскрипционных факторов по ChIP-seq для человека и мыши.
HOCOMOCO — https://hocomoco11.autosome.org/
Тема: геномика, мотивы ДНК.
Ценность: модели связывания 680 человеческих и 453 мышиных транскрипционных факторов (PWM по ChIP-seq из GTRD).
VDJdb — https://vdjdb.com/
Тема: иммунология, TCR.
Ценность: курируемая база Т-клеточных рецепторов с известной антигенной специфичностью (ИБХ РАН).
EpiFactors — https://epifactors.autosome.org/
Тема: эпигенетика.
Ценность: белки и комплексы эпигенетической регуляции плюс экспрессия в клетках, раковых линиях и тканях (МФТИ).
Медицина и ML
MosMedData — https://mosmed.ai/datasets
Тема: медицинская визуализация.
Ценность: открытые КТ-наборы (в т.ч. COVID-19) Центра диагностики и телемедицины ДЗМ — готовые датасеты для обучения моделей.
Medical Data Hub — https://medicaldatahub.ru/datasets/
Тема: медицинские датасеты для ML.
Ценность: каталог медицинских наборов под машинное обучение.
Гуманитаристика, соцнауки, вузы
Dataverse Пушкинского Дома — https://dataverse.pushdom.ru
Тема: русская литература и фольклор.
Ценность: открытые исследовательские данные ИРЛИ РАН с DOI.
Репозиторий психологических данных — https://ruspsydata.figshare.com
Тема: психология.
Ценность: данные и инструменты исследований МГППУ.
DSpace СПбГУ — https://dspace.spbu.ru
Тема: университетский репозиторий.
Ценность: публикации, диссертации и датасеты сообщества СПбГУ (есть API DSpace 7).
#opendata #datasets #russia #researchdata
Земля, океан, климат
ЕСИМО — http://esimo.ru
Тема: океан, метеорология, гидрология.
Ценность: единая государственная система Росгидромета об обстановке в Мировом океане — официальный контур морских и гидрометеоданных, а не институтский архив.
Всемирный центр данных по метеорологии (Обнинск) — http://meteo.ru/mcd/ewdcmet.html
Тема: метеорология.
Ценность: российский узел сети World Data Centres: сбор и распространение метеоданных внутри страны и в международном обмене (ВНИИГМИ–МЦД).
Всемирный центр радиационных данных (WRDC) — http://wrdc.mgo.rssi.ru/
Тема: климат, солнечная радиация.
Ценность: один из шести мировых центров программы GAW ВМО; архив актинометрических наблюдений ГГО им. Воейкова.
Всемирный центр данных по солнечно-земной физике (Москва) — http://www.wdcb.ru/stp/index.en.html
Тема: геофизика, космос.
Ценность: архив наблюдений солнечно-земной физики Геофизического центра РАН.
Геомагнитный центр ГЦ РАН — https://geomag.gcras.ru/
Тема: геомагнетизм.
Ценность: данные обсерваторий INTERMAGNET по России и ближнему зарубежью, плюс спутниковые продукты (система MAGNUS).
Астрономия и физика
Центр астрономических данных ИНАСАН — https://www.inasan.ru/en/divisions/dpss/cad/
Тема: астрономия.
Ценность: с 1980 года российский филиал CDS Strasbourg; каталоги звёзд, переменных и двойных систем для отечественной астрономии.
SPECTR-W3 — http://spectr-w3.snz.ru/index.phtml
Тема: атомная спектроскопия, физика плазмы.
Ценность: одна из крупнейших баз по спектрам атомов и высокозарядных ионов (РФЯЦ–ВНИИТФ): уровни, линии, вероятности переходов, сечения.
Биоразнообразие и коллекции
Российский GBIF IPT — http://gbif.ru:8080/ipt/
Тема: биоразнообразие.
Ценность: национальный узел публикации occurrence-данных в GBIF (ИМПБ РАН / ИПМ им. Келдыша).
«Ноев ковчег», МГУ — https://depo.msu.ru/ipt/
Тема: живые системы, биоматериалы.
Ценность: депозитарий МГУ — от молекул до организмов; наборы публикуются в GBIF.
IPT ЗИН РАН и БИН РАН — https://ipt.zin.ru
Тема: зоология и ботаника.
Ценность: данные крупнейших академических коллекций — Зоологического и Ботанического институтов РАН.
IPT Института океанологии им. Ширшова — https://gbif.ocean.ru/ipt/
Тема: морская биология.
Ценность: встречи, плотность и биомасса видов с экспедиций ИО РАН.
Молекулярная биология (российские базы мирового уровня)
CSDB — https://csdb.glycoscience.ru/database/
Тема: гликомика.
Ценность: курируемая база природных углеводных структур с таксономией, литературой и ЯМР (ИОХ РАН).
GTRD — https://gtrd.biouml.org/
Тема: регуляция транскрипции.
Ценность: сайты связывания транскрипционных факторов по ChIP-seq для человека и мыши.
HOCOMOCO — https://hocomoco11.autosome.org/
Тема: геномика, мотивы ДНК.
Ценность: модели связывания 680 человеческих и 453 мышиных транскрипционных факторов (PWM по ChIP-seq из GTRD).
VDJdb — https://vdjdb.com/
Тема: иммунология, TCR.
Ценность: курируемая база Т-клеточных рецепторов с известной антигенной специфичностью (ИБХ РАН).
EpiFactors — https://epifactors.autosome.org/
Тема: эпигенетика.
Ценность: белки и комплексы эпигенетической регуляции плюс экспрессия в клетках, раковых линиях и тканях (МФТИ).
Медицина и ML
MosMedData — https://mosmed.ai/datasets
Тема: медицинская визуализация.
Ценность: открытые КТ-наборы (в т.ч. COVID-19) Центра диагностики и телемедицины ДЗМ — готовые датасеты для обучения моделей.
Medical Data Hub — https://medicaldatahub.ru/datasets/
Тема: медицинские датасеты для ML.
Ценность: каталог медицинских наборов под машинное обучение.
Гуманитаристика, соцнауки, вузы
Dataverse Пушкинского Дома — https://dataverse.pushdom.ru
Тема: русская литература и фольклор.
Ценность: открытые исследовательские данные ИРЛИ РАН с DOI.
Репозиторий психологических данных — https://ruspsydata.figshare.com
Тема: психология.
Ценность: данные и инструменты исследований МГППУ.
DSpace СПбГУ — https://dspace.spbu.ru
Тема: университетский репозиторий.
Ценность: публикации, диссертации и датасеты сообщества СПбГУ (есть API DSpace 7).
#opendata #datasets #russia #researchdata