На днях в Nature вышла статья про новую мультиомиксную технологию определения стареющих клеток. Их таких море, но тут есть изюминка.
Ученые объединили данные одноклеточного секвенирования РНК (как там каждая клеточка работает), пространственную транскриптомику (чтобы понять где именно эти клеточки, а не просто что-то там в супе) и гипреспектральную рамановскую визуализацию.
В итоге получилось сопоставить транскрипционную программу клетки и реальное наличие определенного типа молекул в клетке, при том без биохимии и прокрашивания - это надо делать до секвенирования и прочих анализов, на живых клетках.
Там море ограничений, начиная с того, что модель обучили распознавать только клетки с p21+ (один из факторов, останавливающих деление клетки, замораживающих её в "зомби" состоянии), заканчивая низкой глубиной просвечивания клеток, да и других ограничений море, не говоря о сложности и стоимости.
Но любопытно совсем другое. Что это за рамановская спектральная что-то там? Если вы тоже об этом ничего не слышали - то вот вам любопытная история ⬇️
Ученые объединили данные одноклеточного секвенирования РНК (как там каждая клеточка работает), пространственную транскриптомику (чтобы понять где именно эти клеточки, а не просто что-то там в супе) и гипреспектральную рамановскую визуализацию.
В итоге получилось сопоставить транскрипционную программу клетки и реальное наличие определенного типа молекул в клетке, при том без биохимии и прокрашивания - это надо делать до секвенирования и прочих анализов, на живых клетках.
Там море ограничений, начиная с того, что модель обучили распознавать только клетки с p21+ (один из факторов, останавливающих деление клетки, замораживающих её в "зомби" состоянии), заканчивая низкой глубиной просвечивания клеток, да и других ограничений море, не говоря о сложности и стоимости.
Но любопытно совсем другое. Что это за рамановская спектральная что-то там? Если вы тоже об этом ничего не слышали - то вот вам любопытная история ⬇️