ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ДЕРЕВО.
Часть 2.
Продолжу разбирать эту тему.
❓Как, используя масштабный отрезок, можно рассчитать дистанцию между двумя таксонами на дереве?
❗Ответ:
➡️ Необходимо сложить сумму всех ветвей, которые кратчайшим образом соединяют два таксона, начиная от общего предка.
✔️ Например, в случае если мы хотим рассчитать дистанцию между мышью и человеком, то сложим два отрезка (один отрезок от «узла» до человека и другой отрезок от «узла» до мыши).
👉 Получается, что дистанция на таком дереве между человеком и мышью будет составлять 20 %.
❗Сложнее рассчитать расстояние между человеком и мухой.
✔️В данном случае предок будет в более глубоком узле и необходимо сложить между собой все масштабные отрезки.
✔️Но ветвь от корня до мухи не делится нацело на 10, а значит, мы не можем представить её в виде двух стандартных отрезков.
✔️Поэтому один отрезок показан пунктиром.
Получается, что дистанция от корня до мухи – примерно 15 %.
👉 Такие же два отрезка ведут от корня до человека. А значит, согласно нашему филогенетическому дереву расстояние между человеком и мухой составит 30 %.
❓Но как соотнести между собой время расхождения между таксонами и долю накопленных различий в генах между ними?
Разберем в следующем посте.
#подготовкакэкзамену
Часть 2.
Продолжу разбирать эту тему.
❓Как, используя масштабный отрезок, можно рассчитать дистанцию между двумя таксонами на дереве?
❗Ответ:
➡️ Необходимо сложить сумму всех ветвей, которые кратчайшим образом соединяют два таксона, начиная от общего предка.
✔️ Например, в случае если мы хотим рассчитать дистанцию между мышью и человеком, то сложим два отрезка (один отрезок от «узла» до человека и другой отрезок от «узла» до мыши).
👉 Получается, что дистанция на таком дереве между человеком и мышью будет составлять 20 %.
❗Сложнее рассчитать расстояние между человеком и мухой.
✔️В данном случае предок будет в более глубоком узле и необходимо сложить между собой все масштабные отрезки.
✔️Но ветвь от корня до мухи не делится нацело на 10, а значит, мы не можем представить её в виде двух стандартных отрезков.
✔️Поэтому один отрезок показан пунктиром.
Получается, что дистанция от корня до мухи – примерно 15 %.
👉 Такие же два отрезка ведут от корня до человека. А значит, согласно нашему филогенетическому дереву расстояние между человеком и мухой составит 30 %.
❓Но как соотнести между собой время расхождения между таксонами и долю накопленных различий в генах между ними?
Разберем в следующем посте.
#подготовкакэкзамену