Закулисье МатМодельера dan repost
Кажется, у меня случился тот самый момент, когда проект перестаёт быть папкой на ноутбуке.
BiomechPy 1.1.0 опубликован.
Теперь его действительно можно установить одной командой:
pip install biomechpy
BiomechPy — это Python-библиотека для механики мягких биологических тканей, роста и ремоделирования, constituent turnover и constrained-mixture моделей.
И самое важное для меня здесь даже не сам факт публикации.
Перед релизом библиотека прошла тот уровень проверки, который я давно хотела видеть у собственных вычислительных проектов: тесты, научные инварианты, независимый аудит, сравнение NumPy и DOLFINx, реальные MPI-запуски на 1/2/4 процессах, проверку wheel и source distribution в чистых окружениях.
То есть в какой-то момент это перестало быть:
«у меня вроде работает».
И стало:
«вот постановка, вот эталон, вот независимые проверки, вот воспроизводимый результат».
Для математического моделирования эта разница, пожалуй, важнее количества написанных строк кода.
Пока BiomechPy не пытается быть «библиотекой вообще обо всём». В текущей версии ядро — это конечные деформации, волоконно-армированная механика, рост и ремоделирование, turnover составляющих ткани, когортная память и пространственные constrained-mixture модели.
Дальше хочется двигаться уже к экспериментальным данным, калибровке и обратным задачам.
Но сегодня можно просто зафиксировать:
первая стабильная публичная версия — есть.
GitHub: https://github.com/karinaurazova/biomechpy
PyPI: https://pypi.org/project/biomechpy/
И да. Теперь фраза «я написала библиотеку» звучит чуть менее подозрительно, потому что её хотя бы можно поставить через pip.
#матмоделирование #биомеханика #mechanobiology #python #opensource #BiomechPy #ЗакулисьеМатМодельера
BiomechPy 1.1.0 опубликован.
Теперь его действительно можно установить одной командой:
pip install biomechpy
BiomechPy — это Python-библиотека для механики мягких биологических тканей, роста и ремоделирования, constituent turnover и constrained-mixture моделей.
И самое важное для меня здесь даже не сам факт публикации.
Перед релизом библиотека прошла тот уровень проверки, который я давно хотела видеть у собственных вычислительных проектов: тесты, научные инварианты, независимый аудит, сравнение NumPy и DOLFINx, реальные MPI-запуски на 1/2/4 процессах, проверку wheel и source distribution в чистых окружениях.
То есть в какой-то момент это перестало быть:
«у меня вроде работает».
И стало:
«вот постановка, вот эталон, вот независимые проверки, вот воспроизводимый результат».
Для математического моделирования эта разница, пожалуй, важнее количества написанных строк кода.
Пока BiomechPy не пытается быть «библиотекой вообще обо всём». В текущей версии ядро — это конечные деформации, волоконно-армированная механика, рост и ремоделирование, turnover составляющих ткани, когортная память и пространственные constrained-mixture модели.
Дальше хочется двигаться уже к экспериментальным данным, калибровке и обратным задачам.
Но сегодня можно просто зафиксировать:
первая стабильная публичная версия — есть.
GitHub: https://github.com/karinaurazova/biomechpy
PyPI: https://pypi.org/project/biomechpy/
И да. Теперь фраза «я написала библиотеку» звучит чуть менее подозрительно, потому что её хотя бы можно поставить через pip.
#матмоделирование #биомеханика #mechanobiology #python #opensource #BiomechPy #ЗакулисьеМатМодельера