🧬 Claude открыл неизвестную генетическую систему
Anthropic запустила собственную группу по биологии и лабораторию. Идея в следующем: дать ИИ-агентам возможность самостоятельно прочёсывать огромные массивы генетических данных, находить странности, формулировать гипотезы и отдавать наиболее интересные находки людям для проверки.
Что сделали?
В первом таком эксперименте Claude искал необычные reverse transcriptases (RT) — обратные транскриптазы. Это ферменты, которые умеют делать копию ДНК на основе РНК.
Claude просмотрел более 200 тыс. известных RT и сузил их до 20 кандидатов для детального анализа. Все это заняло около 21 часа и задействовало примерно 950 параллельных ИИ-агентов.
Один из агентов заметил в ДНК необычную вещь: там находилась длинная последовательность повторяющихся участков, расположенных с определённым интервалом.
Что нашли?
Систему назвали ART (array-associated reverse transcriptase). Она встречается в основном у бактериофагов, вирусов бактерий, и состоит из трёх частей: фермента, гена-партнёра и длинного массива повторов.
➡️ От CRISPR она отличается тем, что рядом нет генов Cas. Вставки между повторами длиннее, около 120–220 нуклеотидов.
➡️ Массив активно «читается» в короткие РНК. По препринту, через 15 минут после заражения они составляют до 8% всех РНК фага.
Функция системы пока неизвестна. Авторы прямо пишут, что не показали ни активности фермента, ни того, что эти РНК служат ему «шаблонами». Их рабочая гипотеза: система устроена как ретрон, то есть один фермент получает набор разных РНК.
Почему это важно?
Если выяснится, что ART действительно использует свои РНК для управления обратной транскриптазой, может оказаться, что природа независимо придумала ещё один способ сделать программируемую молекулярную машину.
Мы знаем несколько природных систем, которые умеют работать с генетической информацией необычно точно:
➡️ CRISPR-Cas — распознавать определённые последовательности и разрезать ДНК;
➡️ reverse transcriptases — переводить информацию из РНК обратно в ДНК;
➡️ retrons — использовать RT + РНК-компонент в защитных системах бактерий;
➡️ diversity-generating retroelements — целенаправленно создавать генетическое разнообразие;
➡️ некоторые RT-Cas системы — соединять возможности обратной транскрипции и CRISPR.
Потенциально ART мог бы применяться для лечения точечных наследственных болезней (серповидноклеточной анемии, муковисцидозе) или заболеваний с потерей функции гена.
Самое потенциально революционное здесь — не «Claude изобрёл новый CRISPR», а то, что ИИ начинает самостоятельно находить в миллиардах генетических последовательностей молекулярные машины, о существовании которых исследователь даже не знал, что стоит искать. И уже потом люди могут превращать эти находки в новые биотехнологии.
💬 Тест Тьюринга. События в сфере ИИ. Подписаться
Anthropic запустила собственную группу по биологии и лабораторию. Идея в следующем: дать ИИ-агентам возможность самостоятельно прочёсывать огромные массивы генетических данных, находить странности, формулировать гипотезы и отдавать наиболее интересные находки людям для проверки.
Что сделали?
В первом таком эксперименте Claude искал необычные reverse transcriptases (RT) — обратные транскриптазы. Это ферменты, которые умеют делать копию ДНК на основе РНК.
Claude просмотрел более 200 тыс. известных RT и сузил их до 20 кандидатов для детального анализа. Все это заняло около 21 часа и задействовало примерно 950 параллельных ИИ-агентов.
Один из агентов заметил в ДНК необычную вещь: там находилась длинная последовательность повторяющихся участков, расположенных с определённым интервалом.
То есть Claude обнаружил целую комбинацию признаков, которую раньше не выделяли как самостоятельную биологическую систему.
Что нашли?
Систему назвали ART (array-associated reverse transcriptase). Она встречается в основном у бактериофагов, вирусов бактерий, и состоит из трёх частей: фермента, гена-партнёра и длинного массива повторов.
➡️ От CRISPR она отличается тем, что рядом нет генов Cas. Вставки между повторами длиннее, около 120–220 нуклеотидов.
➡️ Массив активно «читается» в короткие РНК. По препринту, через 15 минут после заражения они составляют до 8% всех РНК фага.
Функция системы пока неизвестна. Авторы прямо пишут, что не показали ни активности фермента, ни того, что эти РНК служат ему «шаблонами». Их рабочая гипотеза: система устроена как ретрон, то есть один фермент получает набор разных РНК.
Почему это важно?
Если выяснится, что ART действительно использует свои РНК для управления обратной транскриптазой, может оказаться, что природа независимо придумала ещё один способ сделать программируемую молекулярную машину.
Мы знаем несколько природных систем, которые умеют работать с генетической информацией необычно точно:
➡️ CRISPR-Cas — распознавать определённые последовательности и разрезать ДНК;
➡️ reverse transcriptases — переводить информацию из РНК обратно в ДНК;
➡️ retrons — использовать RT + РНК-компонент в защитных системах бактерий;
➡️ diversity-generating retroelements — целенаправленно создавать генетическое разнообразие;
➡️ некоторые RT-Cas системы — соединять возможности обратной транскрипции и CRISPR.
Потенциально ART мог бы применяться для лечения точечных наследственных болезней (серповидноклеточной анемии, муковисцидозе) или заболеваний с потерей функции гена.
Самое потенциально революционное здесь — не «Claude изобрёл новый CRISPR», а то, что ИИ начинает самостоятельно находить в миллиардах генетических последовательностей молекулярные машины, о существовании которых исследователь даже не знал, что стоит искать. И уже потом люди могут превращать эти находки в новые биотехнологии.
💬 Тест Тьюринга. События в сфере ИИ. Подписаться